醫院污水是指醫院（綜合醫院、專業病院及其它類型醫院）向自然環境或城市管道排放的污水。其水質隨不同的醫院性質、規模和其所在地區而異。醫院污水中所含的主要污染物為：病原體（寄生蟲卵、病原菌、病毒等）、有機物、漂浮及懸浮物、放射性污染物等。

醫院污水處理所用工藝必須確保處理出水達標，主要采用的三種工藝有：加強處理效果的一級處理、二級處理和簡易生化處理。

一級強化處理，對于綜合醫院(不帶傳染病房)污水處理可采用“預處理→一級強化處理→消毒”的工藝。

二級處理工藝流程為“調節池→生物氧化→接觸消毒”。適用于傳染病醫院(包括帶傳染病房的綜合醫院)和排入自然水體的綜合醫院污水處理。

簡易生化處理工藝的流程為“沼氣凈化池→消毒”。作為對于邊遠山區、經濟欠發達地區醫院污水處理的過渡措施，逐步實現二級處理或加強處理效果的一級處理。

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